然而，就在城市恢复平静不久，汤姆在木工技艺青少年传承基地的一次常规教学中，发现了一块木材上竟隐隐浮现出与之前奇异世界中相似的古老符号。他立刻找来杰克，两人对着木材上的符号仔细研究，却毫无头绪。
就在此时，城市中一些曾参与过钟楼探秘或滨水区域建设的工人，相继陷入了沉睡，无论如何也唤不醒。他们的梦境中仿佛被迷雾笼罩，只有一个模糊的声音不断重复着：“初始之境，终末之约。”
汤姆和杰克意识到，这可能是之前事件的余波未平。他们决定再次追寻线索，沿着那些工人日常的行动轨迹探寻。在滨水区域的法治文化主题公园角落，他们发现了一块松动的地砖，移开地砖后，出现了一个通往地下的暗道口。
两人顺着狭窄的暗道前行，里面阴暗潮湿，散发着腐臭的气息。墙壁上时不时闪烁着微弱的磷火，仿佛在指引着他们。终于，他们来到了一个巨大的地下溶洞。溶洞中布满了各种奇异的钟乳石，中央有一个巨大的石桌，桌上放置着一本散发着幽光的古籍。
当汤姆触碰到古籍的瞬间，周围的景象突然变幻，他们仿佛置身于城市的过去，看到了最初的建设者们与神秘力量签订的契约——为了城市的繁荣，每过一段时间，都要奉献出一部分人的意识能量给神秘之境，以换取城市的发展机遇。而如今，由于之前的平衡被打破，契约出现了混乱，才导致这些工人被卷入。
汤姆和杰克深知必须修正契约才能彻底解决问题。古籍中记载，修正契约需要找到五颗散落在城市古老遗迹中的灵珠，将它们汇聚在初始之坛。于是，他们开始了新的征程。
他们在城市古老的钟楼顶端找到了第一颗灵珠，其光芒与钟声共鸣；在废弃的工厂深处，找到了被机械守护的第二颗灵珠，它与工业的力量相呼应；在公益农场的古老井中，捞出了与自然生机相连的第三颗灵珠；在历史文化街区的古老祠堂里，获取了蕴含家族传承之力的第四颗灵珠。
当他们来到城市郊外的一座神秘古墓寻找第五颗灵珠时，遇到了重重机关陷阱。杰克凭借对公益事业中帮助弱势群体积累的耐心与智慧，一次次破解机关；汤姆则利用木工技艺制作精巧工具辅助。最终，他们成功拿到了第五颗灵珠。
两人带着五颗灵珠来到了位于城市地下深处的初始之坛。将灵珠放置在相应位置后，一道耀眼的光芒冲天而起，契约开始重新修订。那些沉睡的工人逐渐苏醒，城市也彻底摆脱了神秘力量的错误干扰。
经此一役，汤姆和杰克更加明白，城市的发展不仅是物质的堆砌与科技的进步，更需要守护其背后隐藏的历史、文化与神秘的平衡。他们的故事，也成为了城市永远的传奇，被镌刻在城市新建成的英雄纪念碑上，供后人敬仰与传颂。